בשנת הלימודים תשע"א בית מוריה מפעיל חמישה מעונות יום לילדים בגילאי שלושה חודשים ועד שנתיים ושבעה חודשים. המעונות נמצאים בפיקוח מלא של משרד התמ"ת והם מלווים באנשי מקצוע מנוסים. במעונות אלה מתחנכים כ 200 ילדים. את המעונות מאפיינת אווירה חמה ומשפחתית וניתן בהם יחס אישי לכל ילד. דגש רב ניתן לשילובה של תכנית העשרה המותאמת לכל תחומי ההתפתחות.

כחלק מהמשנה החינוכית של בית מוריה, ניתן דגש על שמירה של קשר רצוף עם ההורים. קשר זה כולל, מלבד היידוע היומיומי אודות התקדמות הילד, גם פעילויות העשרה משותפות של ההורים וילדיהם וכן הרצאות להורים ולצוות בתחומי הדעת השונים. פעילויות אלה מעניקות לכל המשתתפים כלים משותפים, המסייעים ותורמים לרצף חינוכי ועבודה משותפת.